Аббатство было основано Святым Оноре, удалившимся на остров в 410 году. Сент-Онора отделён от Сен-Маргерит 600-метровым проливом. Это название ассоциируется, прежде всего, с обителью Лерин и цистерцианским орденом, которому издавна принадлежали острова. С V века монахи трудятся на этих землях. С начала VI века это был один из самых известных монастырей христианского мира. В X веке недалеко от монастыря был сооружён укреплённый форт для защиты острова. В нём во время нападений несли службу не только солдаты, но и монахи. Обитель процветала примерно до XV века, но затем постепенно пришла в запустение. Современные монастырские постройки, включая церковь, были построены на месте древнего монастыря в XIX веке. В музее монастыря можно увидеть различные экспонаты римской и ранне-христианской эпохи, найденные при раскопках. Кроме этого, на острове можно осмотреть семь часовен, первые из которых были построены для паломников в 6 веке. Самые древние из них – часовни Спасителя и Святого Поркариуса. Остальные относятся к более поздним эпохам.