Радиоастрономический институт был создан в 1966 году путём объединения существующего факультета радиоастрономии университета Бонна, управляемого Отто Хахенбергом, с новым институтом Макса Планка. В 1972 году был открыт 100-метровый радиотелескоп в Эффельсберге в Бад-Мюнстерайфель. Институт расширялся в 1983 и 2002 годах.