Основана в 1742 году при Фридрихе II и именовалась Королевская придворная опера (Königlichen Hofoper). В 1928 году здание театра было реконструировано. Первым спектаклем после нового открытия стала новая постановка «Волшебной флейты» Моцарта. В 1920-х годах за дирижёрским пультом Берлинской оперы стояли такие дирижёры, как Вильгельм Фуртвенглер, Бруно Вальтер, Отто Клемперер, Эрих Кляйбер. После прихода к власти нацистов некоторым дирижёрам (например, Отто Клемпереру) пришлось покинуть театр. Во время Второй мировой войны здание оперы дважды было частично разрушено, в 1941 и 1944 годах. Каждый раз после восстановления (соответственно, в 1942 и 1955 году) театр снова открывался оперой Вагнера «Нюрнбергские мейстерзингеры».